Tikslieji ir gamtos mokslai / Ekologija

Paprastosios sprigės populiacijų genetinės įvairovės tyrimai ir jų analizė

0 atsiliepimų
Autorius:
Tikslui įgyvendinti iškeliami tokie uždaviniai:
• Rasti ir surinkti paprastosios sprigės populiacijas iš geografiškai skirtingų Lietuvos vietovių.
• Apibūdinti molekulinius metodus, naudojamus tiriant Impatiens gentį.
• Pritaikyti Impatiens genties kitų rūšių tyrimams naudojamus metodus paprastosios sprigės molekuliniams tyrimams.
• Aprašyti, paprastosios sprigės tyrimo metodų eigą.


Išvados

• Molekuliniai metodai, tokie kaip DNR barkodingas, atsitiktinai pagaustinta polimorfine DNR (APPD), amplifikuotų fragmentų ilgio polimorfizmas (AFLP), mikrosatelitai ir vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) buvo neseniai pradėti naudoti augalų įvairovės studijoms, naudojami tiriant natūralių ir invazinių augalų sąveiką. Kiekvienas metodas turi savo privalumų ir trūkumų. Šie metodai skiriasi savo skirties geba (rezoliucija) aptikti genetinius skirtumus, generuojamų duomenų tipu ir pritaikomumu įvairiems taksonams.
• Lietuvoje atliekami tik invazinių rūšių tyrimai, o vietinių rūšių tyrimai atliekami neadekvačiai. Todėl atliekant paprastosios sprigės tyrimą naudosiu DNR skyrimo, APPD (atsitiktinai pagausinta polimorfinė DNR) ir mikrosatelitinių žymenų tyrimo metodus pritaikytus augalų genetiniuose tyrimuose ir taip pat tyrimams su sprigėm.
• APPD ir mikrosatelitinių žymenių tyrimų metodų eiga apima šiuos etapus: augalinės medžiagos rinkimas iš geografiškai skirtingų Lietuvos vietovių. Genominės DNR išskyrimas, kuris susideda iš trijų pagrindinių etapų – ląstelių sienelių tirpinimo, baltymų ir likusių priemaišų pašalinimo ir DNR iškirsdinimo. Išskirtos genominės DNR koncentracijos ir švarumo nustatymas, kuris nulemia PGR produktų elektroforezės kokybę. PGR produktų elektroforezė ir DNR elekroforezė poliakrilamidiniame gelyje.
• Paprastoji sprigė buvo surinkta iš geografiškai skirtingų Lietuvos vietovių (Anykščių šilelio, Nevėžio, Vaišvydavos, Upininkų, tarp Šventragio ir Ąžuolyno, Nemirsetos, Marvelės, Seredžiaus, Raudonvario, Prie Nemakščių, Grabuciškių). Iš viso surinkta 11 skirtingų populiacijų po 15 individų iš kiekvienos (viso 165 individų). Patikrinus kitų sprigių rūšių tyrimuose naudotus oligonukleotidinius pradmenis iš jų paprastajai sprigei tiko aštuoni skirtingi oligonukleotidiniai pradmenys: 222, 250, 269, 340, 474, OP - D20, 516, OP - A20, o netiko OP–B7, OP–Q11.
Darbo tipas:
Dalykas:
Apimtis:
13155 žodžiai (-ų)
Lygis:
Universitetas
Atsisiųsti

Turinys

  • Santrumpos2
  • Įvadas3
  • II. LITERATŪROS APŽVALGA4
  • 1.1 Svetimkraščių rūšių invazija4
  • 1.1.1. Globalios klimato kaitos poveikis natūraliai augantiems ir svetimkraščiams augalams4
  • 1.1.2. Invazinių rūšių sąveika su vietinėmis rūšimis6
  • 1.1.2.1. Aplinkos veiksniai, sąlygojantys invazinių augalų plėtrą7
  • 1.1.3. Lietuvos invaziniai augalai ir jų keliama grėsmė vietinei florai8
  • 1.2.Sprigių genties biologija ir paplitimas11
  • 1.2.1 Paprastosios sprigės paplitimas pasaulyje12
  • 1.2.2. Lietuvos natūralios ir invazinės sprigių genties rūšys18
  • 1.3. Metodai, naudojami tiriant natūralių ir invazinių augalų sąveiką20
  • 1.3.1. Sprigių genties molekuliniai tyrimai23
  • II. TYRIMŲ METODAI26
  • 2.1.Augalinės medžiagos rinkimas26
  • 2.2. Genominės DNR išskyrimas29
  • 2.3. Išskirtos genominės DNR koncentracijos ir švarumo nustatymas30
  • 2.4. APPD metodo pritaikymas paprastajai sprigei30
  • 2.5. APPD PGR produktų elektroforezė32
  • 2.6. Mikrosatelitų metodo panaudojimas33
  • 2.7. DNR elekroforezė poliakrilamidiniame gelyje36
  • 2.8. Duomenų analizė37
  • Išvados39
  • Literatūros šaltiniai40

Jums gali būti aktualu

Vartotojai, įsigyję šį darbą, taip pat peržiūrėjo
Natūraliai augančios paprastosios sprigės (impatiens noli-tangere l.) biologijos, paplitimo Lietuvoje, jos ryšio su invazinėmis rūšimis analizė
Kursinis darbas Natūraliai augančios paprastosios sprigės (impatiens noli-tangere l.) biologijos, paplitimo Lietuvoje, jos ryšio su invazinėmis rūšimis analizė

Žemės flora ir fauna vystėsi milijardus metų, jos vandenynai, jūros, kalnų virtinės, dykumos ir netgi [...]

Mielių populiacijos tyrimas
Tyrimas Mielių populiacijos tyrimas

Tikslas – ištirti mielių populiacijos augimo priklausomybę nuo laiko. Hipotezė – Aš manau, jog gavusi maisto [...]

Geninių paukščių buveinių ir populiacijos gausumo tyrimas Ąžuolijos miške
Diplominis darbas Geninių paukščių buveinių ir populiacijos gausumo tyrimas Ąžuolijos miške

Profesionalių mokslinių tyrimų istorija Lietuvoje siekia XVII amžių, taigi paukščių tyrinėjimas mūsų šalyje turi gana [...]

Naujagimių apsigimimo priežasčių analizė ir gimnazistų požiūrio į veiksnius, didinančius apsigimimų riziką, tyrimas
Tyrimas Naujagimių apsigimimo priežasčių analizė ir gimnazistų požiūrio į veiksnius, didinančius apsigimimų riziką, tyrimas

Vaikai – didžiausias mūsų turtas. Mes norime, kad jie būtų sveiki bei laimingi. Tad labai [...]

Klinikinių tyrimų su biopanašiu infliksmabu (CT-P13) analizė ir palyginimas su anksčiau atliktais tyrimais referanciniam vaistiniam preparatui
Referatas Klinikinių tyrimų su biopanašiu infliksmabu (CT-P13) analizė ir palyginimas su anksčiau atliktais tyrimais referanciniam vaistiniam preparatui

Infliksimabas – tai išgrynintas rekombinantinis DNR chimerinis žmogaus ir pelės IgG monokloninis antikūnas, kurį sudaro [...]

Epifitinių kerpių rūšinės įvairovės tyrimo metodika
Referatas Epifitinių kerpių rūšinės įvairovės tyrimo metodika

Viena iš aktualiausių ir svarbiausių daugelio vietovių ekologinių problemų – blogėjanti oro kokybė. Spartus miestų [...]

„Maxima“ prekybos centrų teritorijos aptarnavimo ir pasiekiamumo tyrimas naudojant Network Analyst
Referatas „Maxima“ prekybos centrų teritorijos aptarnavimo ir pasiekiamumo tyrimas naudojant Network Analyst

Technologijoms vis sparčiau žengiant į priekį taip pat ir GIS technologijos įgyja vis didesnį vaidmenį [...]

Sveikatos priežiūros kokybės tyrimas ir analizė
Diplominis darbas Sveikatos priežiūros kokybės tyrimas ir analizė

Šiuolaikinės konku­rencinės rinkos sąlygomis dauguma organizacijų jaučia spaudimą pasiūlyti daugiau ir geresnės kokybės pas­laugų turint [...]

Analysis and comparison of william blake’s poems “london” and “to spring”
Referatas Analysis and comparison of william blake’s poems “london” and “to spring”

William Blake, an English poet, painter and printmaker was born in 1757 and died in [...]

Atviro atsako teksto analizė pagal 5 kokybinio tyrimo duomenų analizavimo etapus
Praktikos ataskaita Atviro atsako teksto analizė pagal 5 kokybinio tyrimo duomenų analizavimo etapus

Užduotis:  atlikti etnografinį interviu su vienu asmeniu (močiute, kai jai buvo 10-15 metų), išanalizuoti pasakojimo [...]

Deivid Hume “Žmogaus protų tyrinėjimas“ antrojo ir trečiojo skyriaus analizė analizė
Rašinys Deivid Hume “Žmogaus protų tyrinėjimas“ antrojo ir trečiojo skyriaus analizė analizė

Kūrinys prasideda pamąstymais apie pojūčius. Jis mano, kad nesvarbu kaip stipriai tu įsivaizduoji kokį nors [...]

Įmonėje „Laivitė“ atlikto tyrimo rezultatų statistinė analizė
Referatas Įmonėje „Laivitė“ atlikto tyrimo rezultatų statistinė analizė

Darbo tikslas – ištirti darbuotojų finansinį išprusimą įmonėje “Laivitė” bei išanalizuoti šios įmonės finansinę veiklą.

“Ebay” įmonės atvejo tyrimo analizė
Referatas “Ebay” įmonės atvejo tyrimo analizė

1995 m. rugsėjo mėn. PierreOmidyar, Silicio slėnio programuotojas, gimęs Paryžiuje, greitosiomis sukūrė namų tinklalapį, kuris [...]

Internetinių rinkos tyrimų analizė
Diplominis darbas Internetinių rinkos tyrimų analizė

Šiandieniniame verslo pasaulyje ekonomikos sąlygos sparčiai kinta. Tai sąlygoja valdymo orientaciją į tikslus, konkurencijos augimas [...]

Asmens išlaidų analizė - tyrimas
Tyrimas Asmens išlaidų analizė - tyrimas

  Šio individualaus namų darbo užduotis - pateiktoje lentelėje sužymėti kiekvienos dienos savo asmenines išlaidas spalio [...]